临床微生物与感染检验

临床微生物与感染检验前沿|2026-06-07

病原体检测、耐药机制、感染流行病学、测序诊断与微生物组。本页由 PubMed 召回、本地预筛和 DeepSeek 价值判断自动生成。

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临床微生物检验

培养、鉴定、药敏、MALDI-TOF、快速诊断、实验室流程和质量控制。

1

An education with audit and targeted feedback intervention to de-implement preoperative surgical urine cultures: a multi-center quasi-experimental study.

Infection control and hospital epidemiology|2026 Jun 05|其他候选期刊|DOI:10.1017/ice.2026.10470
临床微生物与感染检验 临床微生物检验 中优先级 开放状态:OA检查失败 diagnostic stewardshpreoperative urine ceducation audit feedde-implementationquasi-experimental
教育和反馈干预可减少不必要的术前尿培养
为什么值得看

通过多中心准实验证实,以临床医生为中心的教育、审计与反馈能显著降低无症状患者术前尿培养率,为优化检验资源、减少抗菌药物滥用提供了低成本可推广的干预策略。

方法/思路

采用准实验设计,在4个VA医疗中心对神经外科、骨科和血管外科实施教育加培养率审计反馈,对比干预前后尿培养率变化。

可借鉴到哪里

此类诊断管理干预可迁移至其他不必要的检验(如无症状菌尿筛查、重复培养)的去实施研究,帮助减少过度诊疗。

注意点

准实验设计缺乏随机对照,结果受历史趋势和医院环境(退伍军人医院)影响,推广需谨慎。

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耐药与抗菌药物

AMR、耐药机制、耐药基因、抗菌药物管理和耐药监测。

2

Cefepime pharmacokinetics in critically ill children with multiple organ dysfunction syndrome using volumetric absorptive microsampling.

Antimicrobial agents and chemotherapy|2026 Jun 04|感染病/流行病核心|DOI:10.1128/aac.01736-25
临床微生物与感染检验 耐药与抗菌药物 中优先级 开放状态:OA检查失败 VAMS群体药代动力学头孢吡肟重症儿童治疗药物监测
VAMS微采样助力重症儿童头孢吡肟个体化用药
为什么值得看

首次基于VAMS微采样建立MODS重症儿童的头孢吡肟群体药代动力学模型,为儿科抗菌药物个体化治疗与治疗药物监测提供新方法。

方法/思路

前瞻性观察性研究,采用容积吸收微采样(VAMS)收集全血样本,通过非线性混合效应建模建立群体PK模型,并利用体外VAMS:血浆比值(0.58:1)估算血浆浓度。

可借鉴到哪里

VAMS微采样技术可推广至其他抗菌药物在特殊人群(如危重症/新生儿)中的药代动力学研究与临床治疗药物监测。

注意点

VAMS:血浆比值为体外测定,实际体内比值可能波动;样本量较小且为单中心,模型外推需谨慎。

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感染流行病学与监测

院感、暴发调查、传播链、病原谱、公共卫生监测和多中心队列。

3

Post-COVID rebound in invasive pneumococcal disease driven by resurgence of serotype 4 among American Indian individuals in the Southwest United States.

The Journal of infectious diseases|2026 Jun 04|感染病/流行病核心|DOI:10.1093/infdis/jiag285
临床微生物与感染检验 感染流行病学与监测 高优先级 开放状态:OA检查失败 侵袭性肺炎球菌病血清型4美洲印第安人主动监测疫苗覆盖
疫情后IPD反弹:血清型4驱动美洲印第安人社区发病率回升至疫情前
为什么值得看

展示了COVID-19疫情后特定高风险人群IPD快速反弹的流行病学证据,为疫苗策略调整和监测体系强化提供直接参考。

方法/思路

采用主动实验室监测结合血清分型,连续追踪2022-2024年发病率与血清型分布,并对比不同疫苗(PCV20/PCV21)覆盖比例。

可借鉴到哪里

该方法可迁移至其他病原体(如耐药菌)的局部暴发监测,或结合分子分型评估疫苗效果和血清型替代动态。

注意点

研究仅覆盖美国西南部两个美洲印第安人社区,人群和环境特异性较高,外推至其他地区或人群需谨慎;且未报告耐药表型或基因型数据。

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微生物组与宿主互作

肠道菌群、肺部微生物组、菌群失调、宿主免疫和代谢物。

4

TestNet: a method for inferring microbial networks with false discovery rate control for clustered and unclustered samples.

Genome biology|2026 Jun 04|方法/组学/数字医学|DOI:10.1186/s13059-026-04103-0
临床微生物与感染检验 微生物组与宿主互作 中优先级 开放状态:OA检查失败 微生物网络FDR控制置换检验零膨胀聚类样本
TestNet:控制FDR的微生物网络推断方法,处理聚类与零膨胀
为什么值得看

现有微生物网络推断方法缺乏显著性评估且无法处理样本聚类,TestNet通过置换检验控制假阳性率,为临床微生物组可靠推断提供新工具。

方法/思路

基于置换检验生成有效零复制,同时校正成分效应、零膨胀和样本内聚类,实现FDR控制下的微生物网络推断。

可借鉴到哪里

可迁移至临床微生物组(如肠道、呼吸道菌群)网络分析,识别关键菌群互作及其与感染、耐药的相关性。

注意点

方法仅在模拟数据中验证疗效,真实临床样本的聚类结构复杂性和零膨胀程度可能不同于模拟场景,需进一步评估。

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5

High-throughput identification of bacterial β-glucuronidase inhibitors using machine learning.

Gut microbes|2026 Dec 31|临床微生物核心|DOI:10.1080/19490976.2026.2681789
临床微生物与感染检验 微生物组与宿主互作 中优先级 开放状态:OA检查失败 机器学习β-葡萄糖醛酸酶抑制剂筛选自注意力模型肠道微生物组
机器学习高通量筛选肠道菌群GUS抑制剂
为什么值得看

提出了一个可扩展的计算框架,用于高通量发现肠道微生物GUS抑制剂,对改善药物生物利用度和降低胃肠道毒性有转化潜力。

方法/思路

基于1D SMILES嵌入的自注意力分类模型(IC-tf),结合SHAP归因与Transformer注意力进行双重可解释性分析,在3折交叉验证中ROC-AUC达89.3%。

可借鉴到哪里

可直接迁移至临床耐药酶(如碳青霉烯酶、ESBL)抑制剂的高通量虚拟筛选,加速候选化合物发现。

注意点

模型训练数据仅来自122种化合物对大肠杆菌GUS的抑制活性,对其他菌种或耐药酶的泛化能力未经验证。

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跨领域方法启发

不一定是临床微生物领域,但方法可迁移到检验诊断、感染监测或耐药研究。

6

BioMedGraphica: An All-in-One Platform for Joint Textual Biomedical Prior Knowledge and Numeric Graph Generation.

Bioinformatics (Oxford, England)|2026 Jun 05|方法/组学/数字医学|DOI:10.1093/bioinformatics/btag355
临床微生物与感染检验 跨领域方法启发 中优先级 开放状态:OA检查失败 生物医学知识图谱数据整合多组学假说生成跨领域迁移
整合43个数据库构建生物医学知识图谱,可迁移至病原体-耐药知识整合
为什么值得看

该平台整合了分散的生物医学知识资源,构建了统一的知识图谱,可迁移至临床微生物领域的病原体-耐药-抗菌药物知识整合与智能分析。

方法/思路

提出了文本-数值-图(TNG)数据结构,融合了先验知识、定量特征和图关系,为开发新型图分析模型提供理想数据架构。

可借鉴到哪里

可借鉴其方法构建临床微生物领域的知识图谱,整合病原体检测、耐药机制、抗菌药物等信息,辅助检验结果解释和抗菌药物管理。

注意点

该平台主要基于公开数据库,未包含临床微生物领域特定的实验或流行病学数据,实际迁移需补充领域内高质量数据源。

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7

A unified multimodal model for generalizable zero-shot and supervised protein function prediction.

Bioinformatics (Oxford, England)|2026 Jun 04|方法/组学/数字医学|DOI:10.1093/bioinformatics/btag356
临床微生物与感染检验 跨领域方法启发 中优先级 开放状态:OA检查失败 多模态学习蛋白功能预测零样本学习耐药基因预测迁移方法
多模态AI模型可零样本预测蛋白功能,迁移用于耐药基因
为什么值得看

该方法将对比学习与多模态融合用于蛋白功能预测,其零样本能力可启发耐药基因和感染标志物的无标注预测。

方法/思路

FunBind模型联合序列、文本、结构、域注释、GO术语5种模态,通过对比自监督预训练实现零样本功能预测,再经有监督微调提升精度。

可借鉴到哪里

可借鉴该多模态框架构建耐药基因-抗菌药物表型联合预测模型,或从微生物组数据中识别未知功能基因。

注意点

摘要未说明模型在微生物蛋白小样本或耐药相关数据集上的验证情况,需谨慎评估迁移性。

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