临床微生物与感染检验

临床微生物与感染检验前沿|2026-05-23

病原体检测、耐药机制、感染流行病学、测序诊断与微生物组。本页由 PubMed 召回、本地预筛和 DeepSeek 价值判断自动生成。

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临床微生物检验

培养、鉴定、药敏、MALDI-TOF、快速诊断、实验室流程和质量控制。

1

Up-to-date MALDI-TOF MS-based identification of the Corynebacterium diphtheriae species complex for improved diagnostics.

Journal of clinical microbiology|2026 May 22|临床微生物核心|DOI:10.1128/jcm.01324-25
临床微生物与感染检验 临床微生物检验 高优先级 开放状态:OA检查失败 MALDI-TOF MS白喉棒状杆菌复合群数据库扩展开放验证临床微生物鉴定
开放数据库+MALDI-TOF MS精准鉴定白喉棒状杆菌复合群
为什么值得看

直接解决白喉棒状杆菌复合群分类更新后临床鉴定的痛点,验证方法严谨,可推广至其他细菌物种的快速鉴定。

方法/思路

社区驱动的开放数据库(MALDI-UP)扩展+按德国指南系统性验证,用户自建主谱(MSP)交换实现快速更新。

可借鉴到哪里

借鉴该开放验证框架,应对其他临床相关细菌分类修订时的鉴定方法适配。

注意点

摘要未说明局限,但依赖数据库共享质量和用户自建谱图的标准化。

PubMed DOI
2

Comparison of laboratory-developed methods for aztreonam plus ceftazidime-avibactam antimicrobial susceptibility testing for metallo-beta-lactamase-producing Enterobacterales.

Journal of clinical microbiology|2026 May 22|临床微生物核心|DOI:10.1128/jcm.01800-25
临床微生物与感染检验 临床微生物检验 高优先级 开放状态:OA检查失败 联合药敏LDTMBL肠杆菌药敏试验方法肉汤纸片洗脱
联合药敏LDT方法:肉汤纸片洗脱法最可靠
为什么值得看

针对产MBL肠杆菌,比较四种LDT联合药敏方法的准确性与重复性,为临床实验室选择可靠方案提供直接证据。

方法/思路

双中心评估102株产MBL肠杆菌,平行比较BDE、DS、SS、strip-disk四种LDT方法与rBMD的一致性。

可借鉴到哪里

可借鉴其多方法平行比较的设计框架,用于评估其他新型抗菌药组合或耐药菌株的药敏LDT。

注意点

仅针对产MBL肠杆菌,未涵盖其他菌种或耐药机制;DS法重复性差,结果需谨慎解读。

PubMed DOI
3

Performance of the LIAISON PLEX gram-negative blood culture assay for identifying bacterial pathogens and resistance genes in blood cultures.

Journal of clinical microbiology|2026 May 22|临床微生物核心|DOI:10.1128/jcm.00018-26
临床微生物与感染检验 临床微生物检验 高优先级 开放状态:OA检查失败 多重PCR血培养革兰阴性菌耐药基因快速诊断
多中心评估新型多重PCR快速鉴定血培养革兰阴性菌及耐药基因
为什么值得看

直接评估了自动化多重分子检测在血培养阳性标本中快速鉴定19种革兰阴性菌及8种耐药基因的性能,结果优异,对临床快速诊断和抗菌药物管理有直接借鉴意义。

方法/思路

采用多重PCR-液相芯片平台,2小时内完成;前瞻性和预设标本共582例,验证标本746例,全面评价灵敏度、特异度、交叉反应和干扰物影响。

可借鉴到哪里

可借鉴该平台设计思路,扩展至其他病原体或标本类型(如呼吸道、尿液),实现快速多重检测和耐药基因筛查。

注意点

存在17/41的非检测靶标革兰阴性菌交叉反应,需注意不适用于所有革兰阴性菌;且未评估临床预后改善。

PubMed DOI
4

Point-Counterpoint: The "obsoletogram"-are annual hospital antibiograms still relevant?

Journal of clinical microbiology|2026 May 22|临床微生物核心|DOI:10.1128/jcm.00476-26
临床微生物与感染检验 临床微生物检验 高优先级 开放状态:OA检查失败 antibiogram抗菌药物管理耐药监测临床微生物检验辩论
医院年度抗菌谱过时?正反辩论揭示改进方向
为什么值得看

直接涉及临床微生物核心实践——抗菌谱报告的现代适用性与抗菌药物管理决策。

方法/思路

采用点对点辩论结构,对比传统年度累积药敏报告与个体化快速诊断、实时监测的优劣。

可借鉴到哪里

为改进自身机构药敏报告模式(如增加分层、实时更新)提供策略参考。

注意点

摘要未提供具体数据或实证结论,仅为观点性辩论,缺乏实验或临床验证。

PubMed DOI

感染流行病学与监测

院感、暴发调查、传播链、病原谱、公共卫生监测和多中心队列。

5

Gene transfer from NDM-5-producing and OXA-48-producing Enterobacter hormaechei ST79 on contaminated dicloxacillin capsules to other Enterobacterales in Europe, 2020-23: a retrospective, observational, molecular epidemiological study.

The Lancet. Microbe|2026 May 21|顶级综合/医学|DOI:10.1016/j.lanmic.2026.101354
临床微生物与感染检验 感染流行病学与监测 高优先级 开放状态:OA检查失败 碳青霉烯酶质粒介导暴发长读长测序药物污染分子流行病学
药物污染引发碳青霉烯酶基因质粒介导的隐蔽暴发
为什么值得看

揭示常规克隆调查漏检的质粒水平传播链,对院内感染控制和耐药监测策略有直接指导价值。

方法/思路

结合质粒特异性in-silico筛查与长读长测序,从全基因组数据中识别隐藏的质粒介导暴发病例。

可借鉴到哪里

可在其他耐药基因(如KPC、mcr)的分子流行病学监测中推广,提升暴发识别灵敏度。

注意点

摘要未说明主要局限。

PubMed DOI
6

Genomic epidemiology and molecular characterization of Streptococcus pyogenes isolates from pediatric infections in Beijing, China.

Microbiology spectrum|2026 May 22|临床微生物核心|DOI:10.1128/spectrum.03914-25
临床微生物与感染检验 感染流行病学与监测 高优先级 开放状态:OA检查失败 基因组流行病学A族链球菌耐药克隆毒力基因转移儿童感染
北京儿童GAS流行以耐药emm12/em1克隆为主,发现毒力基因转移
为什么值得看

揭示本地GAS克隆扩张及耐药严重性,发现水平转移事件,对区域感染监测和耐药管理有重要价值。

方法/思路

全基因组测序结合系统发育、核心/泛基因组分析,鉴定emm分型、耐药基因与毒力因子,发现克隆动态和基因转移。

可借鉴到哪里

可借鉴其基因组流行病学框架,监测本地优势克隆及耐药毒力基因重组风险。

注意点

样本仅来源北京儿童非侵袭性感染,且时间跨度不足一年,全面性有限。

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7

A method that TRACS multi-species transmission at scale.

Nature microbiology|2026 May 21|顶级综合/医学|DOI:10.1038/s41564-026-02360-0
临床微生物与感染检验 感染流行病学与监测 高优先级 开放状态:OA检查失败 多物种传播传播追踪感染流行病学病原体监测大规模分析
TRACS方法实现多物种传播大规模追踪
为什么值得看

提出一种可扩展的多物种传播追踪方法,直接服务于感染流行病学监测与病原体传播链分析。

方法/思路

TRACS方法能够在规模化层面追踪多物种传播,适用于复杂传播网络的解析。

可借鉴到哪里

可应用于临床微生物实验室的病原体传播链分析及耐药基因在人群与动物间的扩散监测。

注意点

摘要未提供方法细节,需阅读全文验证其具体实现与验证数据。

PubMed DOI
8

PvGAP: Development of a globally-applicable, highly-multiplexed microhaplotype amplicon panel for Plasmodium vivax.

The Journal of infectious diseases|2026 May 21|感染病/流行病核心|DOI:10.1093/infdis/jiag270
临床微生物与感染检验 感染流行病学与监测 高优先级 开放状态:OA检查失败 微单倍型扩增子panel间日疟原虫耐药监测基因分型
可迁移至细菌的真核病原体高效基因分型panel
为什么值得看

该方法学思路可迁移至细菌、真菌等病原体的耐药基因监测与感染溯源,为高效基因分型工具开发提供范例。

方法/思路

基于遗传多样性和遗传距离设计80个高多样性微单倍型靶标和8个耐药相关靶标的多重扩增子panel,实现低成本高分辨率的基因分型。

可借鉴到哪里

借鉴其多重扩增子设计流程,开发适用于院内感染菌或耐药菌的快速基因分型与传播链追踪panel。

注意点

摘要未说明在非疟原虫病原体上的直接验证,迁移至细菌/真菌需重新设计引物并评估跨物种适用性。

PubMed DOI

测序与分子诊断

mNGS、WGS、nanopore、PCR、多重检测、分子分型和系统发育分析。

9

Metagenomic polymorphic toxin effector and immunity profiling predicts microbiome development and disease-related dysbiosis.

mSystems|2026 May 22|临床微生物核心|DOI:10.1128/msystems.00305-26
临床微生物与感染检验 测序与分子诊断 高优先级 开放状态:OA检查失败 宏基因组毒素分泌系统疾病预测微生物组机器学习
毒素分泌系统基因谱预测多种疾病状态
为什么值得看

开发了PolyProf新工具,基于毒素分泌系统基因谱从宏基因组数据中高效区分12种疾病状态,为感染相关微生物组诊断提供新思路。

方法/思路

PolyProf标记基因方法量化约200个效应子与免疫基因,结合细菌分类的弹性网络机器学习模型,显著提升疾病预测性能。

可借鉴到哪里

可迁移至感染宏基因组数据,挖掘微生物竞争相关基因作为感染或耐药的新型诊断标志物。

注意点

摘要未说明局限,主要基于公开数据,需临床队列验证。

PubMed DOI