临床微生物与感染检验

临床微生物与感染检验前沿|2026-05-17

病原体检测、耐药机制、感染流行病学、测序诊断与微生物组。本页由 PubMed 召回、本地预筛和 DeepSeek 价值判断自动生成。

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今日必读

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1

Genomic and Clinical Features Associated with Reduced Susceptibility to Cefiderocol and Cross-resistance to β-lactam/β-lactamase Inhibitors in a Global Cohort of Pseudomonas aeruginosa.

The Journal of infectious diseases|2026 May 15|感染病/流行病核心|DOI:10.1093/infdis/jiag263
临床微生物与感染检验 今日必读 高优先级 开放状态:OA检查失败 铜绿假单胞菌头孢地尔碳青霉烯耐药交叉耐药基因组流行病学
CRPA对头孢地尔敏感性降低与β-内酰胺类交叉耐药相关
为什么值得看

头孢地尔是治疗碳青霉烯耐药铜绿假单胞菌的最后手段药物,该研究揭示其全球范围内敏感度下降,且与多种β-内酰胺类抗生素交叉耐药,对临床用药和实验室监测有直接警示。

方法/思路

利用全基因组测序、肉汤微量稀释药敏、群体分析谱及空心纤维感染模型,综合评估CRPA菌株对头孢地尔的表型与基因型耐药特征及耐药演化风险。

可借鉴到哪里

可借鉴该多维度评估框架,用于其他新型抗生素(如替加环素衍生物)上市后耐药早期预警和临床决策支持。

注意点

仅纳入186株CRPA,样本有限且为观察性设计,需更大规模前瞻性研究验证全球流行率与临床结局。

PubMed DOI

临床微生物检验

培养、鉴定、药敏、MALDI-TOF、快速诊断、实验室流程和质量控制。

2

Controlled human influenza infection reveals heterogeneous expulsion of infectious virus into air.

Cell|2026 May 14|顶级综合/医学|DOI:10.1016/j.cell.2026.02.025
临床微生物与感染检验 临床微生物检验 高优先级 开放状态:OA检查失败 空气传播病原体MIST活病毒检测基因分型临床微生物检验
MIST采样隧道实现空气中感染性流感病毒定量与基因分型
为什么值得看

开发了可捕获空气中感染性病毒并同时培养、定量和测序的模块化采样平台,为临床空气传播病原体检测提供了全新工具。

方法/思路

构建模块化流感采样隧道(MIST),使呼出颗粒直接沉积于细胞单层进行病毒培养与测序,同时采集粒径分布数据。

可借鉴到哪里

可直接迁移至临床环境(如医院候诊区、隔离病房)实时检测空气中结核、呼吸道病毒等活病原体及其基因型。

注意点

研究基于人体感染控制实验,真实复杂环境中的采样效率和干扰因素需进一步验证。

PubMed DOI
3

Inflammatory Cytokine Profile in Pregnant Women Colonized With Group B Streptococcus Reveals IL-17a as a Potential Biomarker to Identify at-risk Newborns.

The Journal of infectious diseases|2026 May 15|感染病/流行病核心|DOI:10.1093/infdis/jiag092
临床微生物与感染检验 临床微生物检验 高优先级 开放状态:OA检查失败 GBSIL-17A生物标志物母婴传播宿主免疫
IL-17A可预测GBS定殖孕妇新生儿感染风险
为什么值得看

该研究将宿主免疫标志物与病原体定殖后的传播风险直接关联,为临床微生物检验中的风险分层和诊断管理提供了新工具。

方法/思路

前瞻性队列中检测孕妇及脐血细胞因子谱,结合体外刺激实验,发现IL-17A可作为预测新生儿GBS侵袭性疾病的生物标志物。

可借鉴到哪里

可将宿主细胞因子检测引入产前GBS筛查,帮助识别需产时抗生素预防的高危母婴对。

注意点

样本量及人群(摩洛哥)代表性有限,且IL-17A的临床阈值和检测标准化需进一步验证。

PubMed DOI
4

Rhinovirus-Associated Lower Respiratory Tract Infection in Hospitalized Adult Patients: A Retrospective Cohort Study.

The Journal of infectious diseases|2026 May 15|感染病/流行病核心|DOI:10.1093/infdis/jiaf651
临床微生物与感染检验 临床微生物检验 中优先级 开放状态:OA检查失败 鼻病毒下呼吸道感染组织嗜性免疫荧光预测因子
鼻病毒下呼吸道感染获组织学证据,预测因子明确
为什么值得看

首次通过活检标本免疫荧光证实鼻病毒在下呼吸道的组织嗜性,并明确男性、发热、咳嗽为独立预测因子,对临床诊断和抗感染策略有参考意义。

方法/思路

采用支气管活检标本免疫荧光染色验证病毒蛋白,结合多变量logistic回归分析临床预测因子。

可借鉴到哪里

可借鉴该活检-免疫荧光验证方法,用于其他呼吸道病原体的组织嗜性及致病性研究。

注意点

回顾性设计、活检样本量小(13例),可能影响结果稳健性;单中心数据需谨慎外推。

PubMed DOI
5

Is it okay to use a commercially available AST for Burkholderia cepacia complex?

Journal of clinical microbiology|2026 May 14|临床微生物核心|DOI:10.1128/jcm.01871-25
临床微生物与感染检验 临床微生物检验 高优先级 开放状态:OA检查失败 商业ASTBurkholderia cepacia药敏试验方法学评估临床微生物检验
商业AST系统对Burkholderia cepacia complex的适用性评价
为什么值得看

直接评估了Vitek 2、Sensititre、Etest等常用商业药敏系统对难治菌BCC的准确性,为临床实验室选择AST方法提供直接依据。

方法/思路

对比商业AST方法与参考肉汤微量稀释法对46株BCC参考菌株的药敏结果,评估重复性和性能,指出Sensititre可能是可行选择。

可借鉴到哪里

可为其他耐药菌(如CRE、MRSA)的商业AST方法评估提供类似验证流程和挑战讨论的参考。

注意点

仅基于参考菌株,未涉及临床菌株,外推性有限;且为评论文章,未提供原始实验细节。

PubMed DOI
6

Utility of Repeating Blood Cultures in Candidemia: Insights From 2 Large Clinical Data Repositories.

Clinical infectious diseases : an official publication of the Infectious Diseases Society of America|2026 May 14|感染病/流行病核心|DOI:10.1093/cid/ciag216
临床微生物与感染检验 临床微生物检验 中优先级 开放状态:OA检查失败 重复血培养念珠菌血症临床微生物检验大数据检验流程优化
重复血培养显著提高念珠菌血症检出率
为什么值得看

利用大型电子健康记录数据,评估重复血培养对念珠菌血症诊断的实际价值,为临床检验流程优化提供大数据支持。

方法/思路

基于两个大型电子健康记录数据集,分析1386次念珠菌血症事件,比较重复血培养在初始阴性后的阳性检出率。

可借鉴到哪里

可借鉴此方法评估其他检验流程(如重复痰培养、重复尿培养等)的临床效用,推动基于证据的检验优化。

注意点

回顾性数据可能存在混杂因素,且不同医院检出率差异大,需谨慎推广。

PubMed DOI

耐药与抗菌药物

AMR、耐药机制、耐药基因、抗菌药物管理和耐药监测。

7

Decoding Hypervirulence in Carbapenem-Resistant Klebsiella pneumoniae: Genomic and Phenotypic Profiling Reveals Capsular Polysaccharide as a Key Driver of Pathogenicity.

The Journal of infectious diseases|2026 May 15|感染病/流行病核心|DOI:10.1093/infdis/jiag075
临床微生物与感染检验 耐药与抗菌药物 高优先级 开放状态:OA检查失败 碳青霉烯耐药肺炎克雷伯菌高毒力荚膜多糖rcsAGWAS
荚膜多糖和rcsA是高毒力碳青霉烯耐药肺炎克雷伯菌的关键驱动与诊断标志物
为什么值得看

该研究通过基因组与表型分析,明确了高毒力CRKP的关键毒力驱动因子,为耐药菌毒力评估和感染防控提供了可靠生物标志物。

方法/思路

整合小鼠模型、GWAS、转录组及表型分析,发现荚膜产量和rcsA表达可独立区分高毒力CRKP,并揭示rcsA介导的荚膜上调增强巨噬细胞抗吞噬作用。

可借鉴到哪里

该联合分析方法可推广至其他高毒力耐药病原体(如高毒力CRE、MRSA)的毒力决定簇鉴定和快速检测标志物筛选。

注意点

该研究主要基于59株菌的小鼠模型,样本量和动物模型向临床转化的普适性需进一步验证。

PubMed DOI
8

Emerging β-lactam and β-lactamase inhibitor strategies for complicated urinary tract infections.

Lancet (London, England)|2026 May 16|顶级综合/医学|DOI:10.1016/S0140-6736(26)00703-8
临床微生物与感染检验 耐药与抗菌药物 高优先级 开放状态:OA检查失败 cUTIβ-内酰胺酶抑制剂耐药抗菌药物管理综述
Lancet综述新型β-内酰胺酶抑制剂治疗cUTI策略
为什么值得看

顶级医学期刊Lancet的系统性综述,直接聚焦复杂性尿路感染的耐药问题及新型β-内酰胺/β-内酰胺酶抑制剂组合,对临床微生物检验中的药敏试验和耐药监测具有指导意义。

方法/思路

文章综合分析了多种新型β-内酰胺酶抑制剂(如头孢他啶-阿维巴坦、亚胺培南-雷利巴坦等)在cUTI中的药理学、临床疗效及对耐药性的影响。

可借鉴到哪里

可借鉴其中推荐的药敏试验方法或耐药监测指标,优化临床实验室对cUTI耐药菌株的检测流程。

注意点

摘要未说明具体方法细节,且为综述类型,缺乏原始研究数据,需注意其推荐策略的时效性和适用性。

PubMed DOI

感染流行病学与监测

院感、暴发调查、传播链、病原谱、公共卫生监测和多中心队列。

9

The FIFA World Cup as a global sentinel event for antimicrobial resistance.

The Lancet. Microbe|2026 May 14|顶级综合/医学|DOI:10.1016/j.lanmic.2026.101441
临床微生物与感染检验 感染流行病学与监测 高优先级 开放状态:OA检查失败 耐药监测大型赛事跨国传播哨点设计感染流行病学
世界杯作为全球抗菌药物耐药性哨兵事件
为什么值得看

提出将大型国际赛事作为耐药性主动监测的全球哨兵,思路新颖,为跨国传播风险提供实时预警视角。

方法/思路

以FIFA世界杯这类人群高度聚集、跨国流动的赛事为平台,设计标准化采样与耐药性检测网络,评估AMR跨境扩散。

可借鉴到哪里

可迁移至其他大型集会(如奥运会、朝觐、展会),构建临时性但高分辨率的耐药性流行病学监测体系。

注意点

文章仅为观点或研究设想,尚无实证数据支撑,实际执行中的协调、标准化与隐私问题文中未展开。

PubMed DOI
10

Genetic evidence of cross-border Plasmodium vivax spread in a malaria pre-elimination region of South Asia.

The Journal of infectious diseases|2026 May 15|感染病/流行病核心|DOI:10.1093/infdis/jiag268
临床微生物与感染检验 感染流行病学与监测 高优先级 开放状态:OA检查失败 微单倍型跨境传播间日疟原虫分子流行病学遗传监测
微单倍型基因分型监测跨境疟原虫传播的方法迁移
为什么值得看

该研究展示高分辨率微单倍型分型可有效追踪跨境病原体传播,方法学直接适用于细菌耐药克隆的跨境溯源。

方法/思路

采用93个微单倍型panel对南亚六国间日疟原虫进行基因分型,通过IBD分析鉴定国家内及国家间遗传簇,区分本地与输入病例。

可借鉴到哪里

该微单倍型panel设计思路可迁移至CRE、MRSA等耐药菌的跨境传播监测,指导感染防控与抗菌药物管理。

注意点

部分国家样本量较小(如不丹、尼泊尔),且数据主要来自临床试验而非全人群监测,可能低估传播异质性。

PubMed DOI
11

Concurrent Detection of Swine-Origin Influenza A(H1N1) Virus in Pigs and Farmer, Switzerland.

Emerging infectious diseases|2026 May 14|感染病/流行病核心|DOI:10.3201/eid3206.251487
临床微生物与感染检验 感染流行病学与监测 中优先级 开放状态:OA检查失败 全基因组测序人畜共患流感病毒流行病学监测跨物种传播
瑞士猪源H1N1流感病毒人畜共患传播的基因组学证据
为什么值得看

通过全基因组测序确认猪流感病毒跨物种传播,对理解人畜共患病原体传播链具有直接参考价值。

方法/思路

采用全基因组测序比较猪与人分离株的基因组同源性(>99.9%),结合流行病学调查追踪传播事件。

可借鉴到哪里

该基因组流行病学方法可迁移至医院内多重耐药菌的接触者追踪和传播链重建。

注意点

摘要未说明样本量、传播时间线及是否存在其他潜在传播来源。

PubMed DOI
12

Understanding and exploiting superspreading to disrupt Mycobacterium tuberculosis transmission.

The Lancet. Infectious diseases|2026 May 14|顶级综合/医学|DOI:10.1016/S1473-3099(26)00168-4
临床微生物与感染检验 感染流行病学与监测 低优先级 开放状态:OA检查失败 超级传播结核分枝杆菌感染流行病学传播动力学靶向干预
结核超级传播概念用于靶向破坏传播链
为什么值得看

该综述系统梳理了结核分枝杆菌超级传播的异质性特征,提出针对超级传播者进行干预可显著影响传播链,对感染流行病学监测和防控策略设计有重要启发。

方法/思路

基于个体传染性异质性的超级传播概念,结合历史与当代数据,论证了识别超级传播者并实施靶向战略干预的方法。

可借鉴到哪里

可将超级传播识别与干预思路迁移至其他病原体(如耐药菌、呼吸道病毒)的传播监测与精准防控策略设计中。

注意点

综述主要基于结核病流行病学数据,不同病原体的传播动力学和超级传播驱动因素可能差异显著,需谨慎外推。

PubMed DOI

测序与分子诊断

mNGS、WGS、nanopore、PCR、多重检测、分子分型和系统发育分析。

13

Antimicrobial resistance surveillance through wastewater: methodological considerations for metagenomic approaches and public health perspectives.

The Lancet. Microbe|2026 May 15|顶级综合/医学|DOI:10.1016/j.lanmic.2026.101400
临床微生物与感染检验 测序与分子诊断 高优先级 开放状态:OA检查失败 宏基因组测序抗菌药物耐药性废水监测标准化方法学
污水宏基因组AMR监测方法学标准化的临床启示
为什么值得看

顶级期刊方法学综述,系统梳理污水宏基因组耐药监测全流程的关键考量,对临床微生物实验室开展标准化耐药检测有直接指导价值。

方法/思路

总结从样本采集到数据分析各环节的方法学注意事项,强调标准化对数据可比性与可重复性的关键作用,并指出复杂耐药机制可能被低估。

可借鉴到哪里

可将污水监测的标准化思路迁移至临床宏基因组耐药检测流程优化,提升结果可靠性与跨中心可比性。

注意点

作为方法学综述未提供新数据或验证,临床转化仍需针对具体场景的验证研究。

PubMed DOI

微生物组与宿主互作

肠道菌群、肺部微生物组、菌群失调、宿主免疫和代谢物。

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Antibiotic-associated Enterococcus expansion in the gastrointestinal tract precedes infected necrosis in acute necrotizing pancreatitis.

Gut microbes|2026 Dec 31|临床微生物核心|DOI:10.1080/19490976.2026.2670039
临床微生物与感染检验 微生物组与宿主互作 高优先级 开放状态:OA检查失败 肠球菌急性胰腺炎16S rRNA测序抗生素管理感染预测
肠球菌扩张早于胰腺坏死感染,抗生素驱动
为什么值得看

通过16S rRNA测序前瞻性监测,直接揭示早期抗生素使用通过驱动肠球菌扩张增加感染坏死风险,为抗生素管理提供微生物学证据。

方法/思路

前瞻性多中心队列(POEMA),对急性坏死性胰腺炎患者进行30天每两周直肠与唾液采样,利用16S rRNA测序分析菌群动态,结合生存分析评估肠球菌定植与感染坏死的关系。

可借鉴到哪里

可借鉴此纵向监测设计,在ICU或住院感染高风险患者中定期检测肠道菌群,提前预警耐药菌或特定病原体感染。

注意点

因果关系未最终确认,需进一步干预性研究验证限制早期抗生素是否减少感染坏死。

PubMed DOI
15

Immune-microbiome coordination defines interferon setpoints in healthy humans.

Cell|2026 May 14|顶级综合/医学|DOI:10.1016/j.cell.2026.02.003
临床微生物与感染检验 微生物组与宿主互作 高优先级 开放状态:PMC全文 微生物组免疫-微生物组互作干扰素设定点多组学整合健康人
健康人免疫-微生物组协调确定干扰素设定点
为什么值得看

揭示健康人免疫系统与肠道微生物组的稳定协调关系,为理解感染易感性个体差异提供新视角。

方法/思路

采用多组学因子整合分析结合超过一年的纵向随访,发现干扰素反应是健康人中最可变的免疫特征,并与微生物组组成、通路和代谢物协变。

可借鉴到哪里

可借鉴该方法研究感染患者或耐药菌定植者的免疫-微生物组互作,探索感染风险与耐药菌定植的免疫基础。

注意点

研究对象为健康人,结果向感染或疾病人群推广需验证。

PubMed DOI开放全文

跨领域方法启发

不一定是临床微生物领域,但方法可迁移到检验诊断、感染监测或耐药研究。

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A comparison of deep multiomics profiles across ethnicity, geography, and age.

Cell|2026 May 14|顶级综合/医学|DOI:10.1016/j.cell.2026.04.032
临床微生物与感染检验 跨领域方法启发 中优先级 开放状态:OA检查失败 多组学微生物组种族差异队列设计方法迁移
大规模多组学跨种族队列:方法可迁移至感染宿主-微生物互作研究
为什么值得看

该研究将多组学(含微生物组)与种族、地理、年龄系统关联,其队列设计及饮食-微生物组代谢分析思路可直接迁移至感染人群的宿主-微生物互作研究,为临床微生物检验提供方法论借鉴。

方法/思路

对322名健康个体进行涵盖基因组、转录组、蛋白质组、代谢组、脂质组、金属组、糖组及微生物组的综合多组学分析,整合种族、地理、年龄及饮食因素。

可借鉴到哪里

可借鉴其大规模多组学跨种族队列设计及饮食-微生物组代谢分析思路,用于感染人群的微生物组与宿主应答、耐药机制研究。

注意点

样本量较小(322人)且未聚焦感染队列,直接外推至临床微生物检验场景需谨慎。

PubMed DOI