临床微生物与感染检验前沿｜2026-05-16

该研究开发了直接从阳性血培养进行纳米孔宏基因组测序的流程，在3.3小时内完成病原鉴定，比常规培养快约10小时，并额外检测到19例感染（包括混合感染、不易培养及培养阴性样本），具有显著的临床转化潜力。

采用Oxford Nanopore对阳性血培养直接测序，结合Kraken2数据库与随机森林分类模型进行物种预测，同时使用ResFinder、CARD等工具进行耐药基因检测；对比常规培养及MALDI-TOF进行验证。

该直接测序流程可迁移至其他无菌体液（如脑脊液、胸腹水）的快速病原检测和耐药预测，尤其适用于危重患者。

部分物种和药物的耐药预测敏感度与特异度仍需提升，且本研究为单中心验证，推广前需多中心临床验证。

多国大规模前瞻性研究，评估舌拭子作为无创采样替代痰液用于结核分子诊断的准确性，对临床微生物快速诊断和标本优化有直接价值。

多国前瞻性诊断准确性研究，采用标准化舌拭子采集和处理方案，使用Xpert MTB/RIF Ultra检测，以痰培养为金标准。

舌拭子无创采样策略可迁移至其他呼吸道感染或耐药病原体检测场景。

灵敏度中等（65.6%），且在不同中心和HIV阳性人群中差异大，部分站点无效/错误率高。

直接评估标准与改良两步法在早期莱姆病中的诊断效能，为优化其他感染病血清学算法提供对照框架。

基于251例早期莱姆病患者与对照的血清样本，比较四种FDA批准的两步法算法的敏感性与特异性。

可借鉴该两步法评估框架，用于结核、梅毒等病原体血清学诊断算法的敏感性与特异性比较。

样本仅来自美国东海岸和中西部，结果推广至其他地域或莱姆病晚期需谨慎。

该研究在GeneXpert平台上扩展耐药检测靶标，弥补现有金标准Xpert Ultra漏检rpoB I491F突变和无法检测异烟肼耐药的缺陷，性能相当且具额外优势。

开发MDRmDx检测，基于10色GeneXpert仪器，直接痰中检测结核分枝杆菌、利福平耐药（RRDR+I491F）和异烟肼耐药（katG/fabG1/inhA启动子）。

可借鉴其平台扩展策略，开发其他多重耐药病原体的即时检测组合，利用现有分子诊断设备增加检测通量和靶标。

临床验证仅用回顾性冷冻富集样本，未报告前瞻性多中心数据，真实世界灵敏度/特异性需进一步确认。

多中心验证为临床实验室选择厌氧菌纸片扩散法AST提供了来自不同厂商琼脂和纸片的实际性能数据，直接指导方法学优化。

使用多种厂商的FAA-HB琼脂和药敏纸片，以琼脂稀释法MIC为参考，计算分类符合率、重大及极重大误差。

该验证设计可推广至其他AST方法（如肉汤微量稀释法）或细菌-药物组合的性能评估。

对普雷沃菌属生长不良及β-内酰胺/β-内酰胺酶抑制剂组合（尤其哌拉西林/他唑巴坦）性能不可接受，限制其常规应用。

直接评估了多重PCR胃肠道面板重复检测的诊断收益，为优化实验室检测流程和诊断管理提供了数据支持。

多中心回顾性队列设计，通过计算重复检测的NNT（24例才能发现1个新病原体）量化诊断价值；该分析方法可迁移至其他分子检测项目（如呼吸道或血培养面板）的重复检测评估。

借鉴其NNT计算和诊断管理思路，制定实验室重复检测政策，减少不必要的检测浪费。

排除了C. difficile结果，且未纳入儿科人群，结论可能不适用于所有患者群体。

多中心前瞻性研究揭示了新型β-内酰胺/β-内酰胺酶抑制剂对碳青霉烯耐药铜绿假单胞菌（CRPA）的耐药流行情况及其对患者预后的影响，直接指导临床用药与耐药监测。

采用DOOR评分比较耐药与敏感菌株感染患者的临床结局，结合多中心前瞻性队列设计评估耐药菌感染的预后差异。

该DOOR评分联合多中心队列的方法可推广至其他耐药病原体的预后评估和抗菌药物疗效比较研究。

数据来自2018-2019年，可能不反映最新耐药趋势；部分亚组（如菌血症）样本量较小，结论需谨慎解读。

多中心真实世界研究明确了CAZ-AVI在42小时内启动可提高临床成功率并降低死亡率，为MDR感染治疗时机提供直接证据。

回顾性队列（22个中心，613例）结合CART分析确定最佳启动时间阈值42小时，并评估早期与晚期启动对临床成功率和30天死亡率的影响。

提示在新型抗菌药物疗效评估中，应重点分析治疗时机的影响，可推广至其他耐药菌感染治疗方案的优化。

回顾性设计，混杂因素未完全控制；阈值源于无既往活性治疗亚组，需前瞻性验证。

从人群消费谱系洞悉耐药驱动机制，引入MIC漂移量化新指标，为生态学研究提供可复用的监测工具。

以SIPI（敏感菌株压力指标）和WIPI（野生型菌株压力指标）描述MIC分布形状变化，捕捉敏感谱系内MIC漂移，并与抗生素消费做时序相关性分析。

可迁移至其他病原体（如大肠杆菌、肺炎克雷伯菌）的耐药监测，通过MIC直方图量化亚敏感谱系变化辅助预警。

生态学设计无法排除个体混杂因素，因果推断需谨慎。

首次报告马里等法语西非地区儿童非沙门菌肠杆菌耐药长期趋势，数据触目惊心，对全球AMR监测和临床治疗决策有重要参考价值。

回顾性分析2005-2023年儿科侵袭性细菌感染病例，结合全基因组测序回溯耐药基因型，揭示三代头孢和多重耐药率大幅攀升。

可借鉴其纵向监测设计及WGS方法，在资源有限地区建立类似耐药趋势追踪体系。

单中心回顾性研究，样本量有限，可能不代表西非整体情况。

该3期试验证实cefepime-nacubactam对复杂性尿路感染的临床与微生物学成功率显著优于亚胺培南-西司他丁，为耐碳青霉烯革兰阴性菌治疗提供了新选项。

全球多中心随机双盲3期试验，以复合临床与微生物学成功为主要终点，采用非劣效性和优效性序贯检验，评估新型β-内酰胺酶抑制剂与头孢吡肟或氨曲南联合方案。

可借鉴其研究设计评估新型快速药敏检测或分子耐药标志物在指导靶向治疗中的临床效能。

摘要未说明纳入菌株的耐药谱具体构成，且入组要求对亚胺培南和美罗培南敏感，限制了结果向碳青霉烯耐药菌株的直接外推。

提出了利用MAIT细胞免疫恢复作为宿主导向策略，增强碳青霉烯对产碳青霉烯酶耐药菌的疗效，为耐药感染治疗提供新思路。

通过抗原与细胞因子组合刺激MAIT细胞，评估其细胞毒性及分泌组对碳青霉烯活性的恢复作用，并验证在HAI患者中恢复功能的可能性。

该方法可借鉴用于开发免疫辅助抗耐药菌策略，或作为临床微生物药敏试验中评估宿主-药物协同作用的新模型。

研究为体外实验，临床转化需验证体内安全性和有效性；未涉及直接检验诊断方法。

该研究首次系统解析了产ESBL和碳青霉烯酶弗氏柠檬酸杆菌在6年间的克隆与质粒介导的传播动力学，填补了该菌院内传播认知空白。

利用Nanopore长读长测序进行全基因组测序、MLST、质粒分型和耐药基因谱分析，结合患者轨迹数据定义克隆传播和质粒介导传播事件。

该方法可迁移至其他院内多重耐药菌（如CRE、MRSA）的精细化监测，整合基因组与流行病学数据追踪传播链。

单中心回顾性设计，可能低估传播范围，且部分菌株仅从直肠拭子分离，临床感染代表性有限。

利用COVID-19旅行限制这一自然实验，结合基因组流行病学方法，揭示了人口流动对耐药菌株传播和多样性的直接影响，为感染监测和政策制定提供实证。

基于常规公共卫生监测的淋病奈瑟菌全基因组测序数据，分析旅行限制前后菌株多样性和耐药基因型变化，采用比较基因组学与系统发育方法。

类似自然实验设计可用于评估其他旅行或政策干预对耐药菌传播的影响，尤其在呼吸道或肠道感染监测中。

摘要未说明样本地区代表性及耐药表型与基因型的一致性验证。

本研究首次通过大规模野外粪便样本验证了非侵入性方法在诺氏疟原虫监测中的可靠性与可扩展性，为One Health框架下的人兽共患病早期预警和环境监测提供了新思路。

利用粪便DNA提取和PCR检测技术，对9个流行国家的4752份野生猕猴粪便样本进行非侵入性监测，检出率8.2%，验证了该方法在自然条件下的可行性。

可迁移至医院环境中病原体（如耐药菌、诺如病毒）或耐药基因的非侵入性环境监测（如废水、拭子），实现低成本早期预警。

摘要未说明

直接针对临床微生物检验中的分子诊断难题，总结mNGS运用于CNS感染的关键变量和解读要点，具有指导价值。

综述标本处理、宿主因素、病原体动力学等对mNGS敏感性的影响，并给出临床整合策略。

这些变量分析思路可迁移到其他感染类型（如血流、呼吸道）的mNGS检测优化中。

未涉及大规模前瞻性验证或成本效益分析，需结合临床多学科判断。